يشغل آل ثاني منصب الرئيس التنفيذي لهيئة المناطق الحرة في قطر منذ عام 2022. وفي عام 2025، نمت قاعدة المستثمرين في الهيئة بنسبة 19% لتصل إلى 837 شركة مرخصة، مع توقعات بأن يصل إجمالي الاستثمارات إلى 5.3 مليار دولار، وتوفير أكثر من 13 ألف فرصة عمل، إلى جانب زيادة المساحات المؤجرة بنسبة 30% لتبلغ 1.7 مليون متر مربع. كما أبرمت الهيئة شراكة مع (WuXi Biologics) لإطلاق أول مركز للبحث والتطوير والتصنيع التعاقدي المتكامل للمنتجات الحيوية تابع لها في الشرق الأوسط، ووقعت اتفاقية مع (Samsung C&T) لـ5 مشاريع تشمل مزرعة طاقة شمسية بقدرة 285 ميغاوات. وبدأت أعمال تأسيس مركز خدمة لشركة سيمنس للطاقة وافتتحت أول مقر إقليمي لمجموعة (Kingdee) بالهيئة. ويشغل آل ثاني عضوية مجالس إدارة وكالة ترويج الاستثمار (استثمر قطر)، وشركة مناطق، وموانئ قطر، وشركة سكك الحديد القطرية (الرّيل).