يهدف المركز الوطني لتنمية القطاع غير الربحي، إلى تعزيز قدرات مؤسسات هذا القطاع على أداء دورها في خدمة المجتمع، وممارسة مسؤوليتها المجتمعية في التنمية والبناء والاستدامة، والعمل على تمكين المنظمات غير الربحية لتحقيق استدامتها المالية، من خلال إيجاد موارد متنوعة ومتطورة، وتنويع مصادر الدخل فيها، ورفع كفاءة الأداء الإداري بما يسهم في تطوير أنشطتها وشراكاتها المجتمعية، ودعم المشاريع الاستثمارية للجهات غير الربحية، ورفع مستوى الشفافية والأداء المالي والإداري.